喀什经济开发区重点发展商贸物流、出口机电产品配套组装加工、农副产品深加工、纺织、建材、冶金、进口资源加工、机械制造、旅游、文化、民族特色产品加工、生物技术、可再生能源、新能源、新材料等产业。其中，喀什市重点建设区域性商贸物流中心、金融贸易区和优势资源转化加工区；伊尔克什坦口岸重点建设进出口商品物流仓储集散中心、进出口产品加工区。